L'évolution , l'embryogénèse, aspects théoriques

Cher Monsieur
toute publicité faite à mes travaux me convient parfaitement, donc, dans le principe, et comme, bien entendu, je suis "sûr de mon coup", je ne vois aucune objection à ce que ce que je raconte soit diffusé le plus largement possible.
Cependant, je vois à votre proposition au moins trois problèmes :
1-ces chats sont sensés être tantôt des discussions à bâtons rompus entre amis, et tantôt cela devient de véritable procès, ce n'est donc pas bien défini, voire incohérent structurellement, donc je vois mal comment vous pourriez aller montrer ça à des personnes extérieures qui n'ont pas tout suivi
2-si votre intention est d'extraire des citations pour illustrer, même à charge et à décharge mes travaux, je pense que ce n'est pas convenable car vous avez montré une attitude trop hostile à mes travaux, et vous allez être à n'en pas douter influencé par votre propre subjectivité, ce n'est ni bien ni mal, c'est comme ça, nous ne sommes pas des machines. Donc, si votre intention est de TOUT traduire, y compris VOS interventions, ça me va. Si vous comptez juste faire des extraits, ça ne me va pas.
3-Sans vouloir vous blesser, j'ai bien compris au fil des débats que vous ne maîtrisez pas la physique du problème, dès qu'il est question de champ de contrainte de rhéofluidification, de champ de directeur, de cristaux liquides, vous passez à autre chose. Donc, je pense que vous n'êtes pas à même de traduire ces passages, dont la subtilité semble vous échapper.
4-Mes travaux sont pour une part publiés, pour une part dans un livre. Vous pouvez très bien trouver des francophones pour donner un avis dessus, je ne vois pas l'impérieuse nécessité de faire ça en anglais. Surtout, si vous pensez que ça ne tient pas la route, à ce point là, vous aurez vite fait de trouver quelques collègues pour vous confirmer dans ce sentiment, y'a pas besoind 'aller emm... des gens avec des bouts de chats mal traduits
5-Enfin, je n'ai jamais été contre votre "petite cabale", contrairement à ce que vous dites. Je dis juste que j'ai autre chose à faire. Organisez ce que vous voulez avec qui vous voulez autour de mes travaux, cela leur fera la meilleure publicité, je ne me sens aucune crainte d'aucune sorte. Vous savez j'ai déjà présenté tout ça à de nombreuses reprises, et même une fois en Californie devant environ 200 personnes (biologistes et médecins) au Saban Institute, et je peux vous dire que l'enthousiasme était général. Le directeur du Saban Institute a conclu sous les bravos avec ce mot "it makes sense".
Evidemment, je ne suis pas contre cette "petite cabale" mais elle ne me dit rien non plus, dans le milieu que je fréquente, au lieu de faire ça, on m'aurait simplement demandé de venir faire un séminaire, ce sont des choses qui se font, entre "pairs". Vous préférez ces règles à vous, personne n'est forcé de vous obéir. Donc, conclusion, je pense que vous n'êtes pas à la hauteur pour servir ni de sparring partenr ni de caisse de résonance à mes travaux, mais comme vous êtes libre, et que je respecte la liberté d'autrui :

je soussigné Vincent Fleury autorise Monsieur Antoine Vekris à traduire mes propos présents sur ce site, aux conditions suivantes :
1 de traduire l'intégralité des échanges ayant eu lieu y compris les interventions de tierces personnes si elles ont donné lieu à des réponses de ma part , et de mentionner dans sa traduction que cette traduction n'est pas revue par l'auteur des propos
2 de poster dans sa traduction un lien vers mon site web où figurent des informations de nature à éclairer le lecteur


Fait à Rennes le 1 février 2007
Vincent Fleury



Ah j'oubliais : par pitié, ne parlez pas d'élégance, pas vous SVP.


[ Ce message a été modifié par : : vincentfleury le 01-02-2007 11:10 ]

pour information, l'abstract d'un article soumis.

In this article, I analyze in detail the physical mechanism of head formation, starting from the blastula stage. The formation of the head is decomposed into three stages of a single physical process. First, a hyperbolic flow acting on the blastula deforms the circle progressively into a somewhat elongated shape having a larger top, and a smaller bottom. Next, a crack (or "streak") nucleates at the point of highest stress, and propagates rapidly a line of epiboly (cellular invagination) along the antero-posterior axis. The shape of the flow on the blastula during this event is computed analytically. Next, a fold forms which follows one loop around the furrow, which is perpendicular to the lines of shear of the flow on top of the epiblast. Eventually, a large 8 shaped embryo forms whose anterior lobe will be the head. In that region, the folds of the anterior lobe are raised vertically, and they spring upwards. As they do, they pivot around two physical singularities which fix the two ends of the brain vesicles. One of these singularities will eventually be the base of the skull, the other one is a point in the region of the eye. As a consequence, it is easy to generate animal deformations very close to the observed ones from dynamics of vector fields which contain very few parameters (the blastula size, the position of the hyperbolic point, the blastula thickness and viscosity, the cellular traction force, the elastic parameters of the extra-cellular matrix). There exist at each step a dimensionless description of the phenomenon in terms of differentiable vector fields. When applyied to the eventual shape of the skull, the model shows that the "inflation" of the head is actually accompanied by a decrease in jaw and teeth size, and a progressive crushing of the eye orbits. As a consequence, there exists an internal bio-mechanical logic to skull and face deformations, which relates the two. This illustrates the concept of correlation due to Darwin. It follows from the mathematical formalism, that there exists an open set of parameters in which the evolution of the head shape is predictible, at least in principle. Considerable deformations of the head can be deterministically obtained by varying only a very small set of parameters. In this set of parameters, an optimal size of jaw and brain becomes likely, since a selective asset (a large jaw) can progressively be traded for another (large brain) deterministically, within a perfectly darwinist context, although the shapes produced by the phenomenon reside entirely within the possibilities of the biomechanics of development. Neither the brain size, nor the jaw size, are the relevant parameter of the problem, but the winding of the dynamics of vector fields. The dimensionless character of the vector field allows one to speak of "jaw", "head" or "leg", independently of the animal instance under study.

ET VOICI UN ÉVENEMENT UIP A NE PAS RATER
... pour tout ceux qui veulent explorer sans a priori les potentialités facinantes de la biologie évolutioniste "post-darwnienne" (encore un scoop uip!) :

Vasily Ogryzko, biologiste moléculaire, Directeur de recherche à l’INSERM, DR2 Groupe Epigénétique Moléculaire, CNRS UMR 8126, Institut Gustave Roussy, Villejuif, présentera pour la première fois au public français un nouveau modèle pour expliquer l’apparition de mutations qui défient les explications darwiniennes.
Venez découvrir une nouvelle approche de l’évolution par un généticien de haut niveau, ayant passé 10 ans en tant chercheur au National Institute of Health américain.
Avec traduction consécutive en Français

Une conférence de l’UIP, le Mercredi 7 février 2007, 19h-22h.
USIC : 18 rue de Varenne, 75007 Paris. Métro : Sèvres-Babylone.
Code: 4617. Salle DelaCommune.

La Physique quantique peut-elle nous aider à mieux comprendre l’évolution ? De nombreux biologistes pensent que non. Vasily Ogryzko n’est pas de cet avis. Il existe chez les bactéries des mutations dites adaptatives qui semblent se produire en fonction de l’environnement dans lequel se situe la bactérie, ce qui nous amène à considérer un néo-lamarckisme. Des 1997, Vasily Ogryzko a publié dans une revue à « referees » un modèle proposant une explication faisant appel à des concepts de la physique quantique. Même si la plupart des propriétés physiques d’une bactérie obéissent aux lois de la physique classique (sa position et sa vitesse par exemple ne sont en rien concernées par le principe d’incertitude), certaines propriétés biologiques essentielles ne peuvent être connues simultanément. Si l’on connaît le génome d’une bactérie, on ne peut pas savoir comment elle va se développer dans certaines conditions. Si l’on observe la façon dont une bactérie mute et se développe dans certaines conditions, on ne connaît pas le génome de la bactérie « mère ».
Il fait alors l’hypothèse selon laquelle les bactéries seraient en état de superposition, comme des objets quantiques, et que les mutations se produiraient lors de la « mesure ». Dans ce cas, l’ensemble des variations possibles du génome de la bactérie dépend des conditions elles-mêmes de la sélection. L’idée centrale d’Ogryzko, c’est qu’il existe des cas dans lesquels on ne peut séparer la variation et le processus de sélection. C’est ce qu’il appelle le Post-darwinisme : « Contrairement au cas darwinien, les variants ne préexistent pas indépendamment les uns des autres avant la sélection, ils sont tous des composants d’un seul état. En d’autres termes, la sélection se produit non parmi une population d’objets mais parmi un ensemble d’états virtuels d’un même objet […] En dépit du fait que la sélection naturelle intervienne, cette sorte d’adaptation, associée ici à la réduction de la fonction d’onde, peut également être considérée comme lamarckienne . »
Des résultats récents ont montré que les explications darwiniennes proposées dans un premier temps pour ces « mutations adaptatives » ne pouvaient en expliquer que 10 % . Les recherches de Vasily Ogryzko retrouvent une pertinence particulière.

L’UIP : 29, rue Viala. 75 015 Paris - Tél : 01 45 78 85 52 - www.uip.edu -
Email : uip@uip.edu

references:
Cairns, Overgbaugh, Miller, « The origins of mutants », Nature 335, 1988, p. 142-145. et B.G. Hall, « Spontaneous point mutations occur more often when advantageous than when neutral », Genetics, 1997, 126, p. 5-16.
Vasily Ogryzko, « A quantum theoritical approach to the phenomenon of directed mutations in bacteria », Biosystems 43, 1997, p. 83-95.
Rosche WA, Foster PL, « The role of transient hypermutators in adaptive mutation in Escherichia coli », Proc Natl Acad Sci, USA, June 1999, 8 ; 96(12):6862-7. Et Roth JR, Kofoid E, Roth FP, Berg OG, Seger J, Andersson DI, « Regulating general mutation rates : examination of the hypermutable state model for Cairnsian adaptive mutation », Genetics, April 2003 ; 163(4) : 1483-96. Et Cairns J, Foster PL, « The risk of lethals for hypermutating bacteria in stationary phase », Genetics, December 2003 ; 165(4) : 2317-8.